Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGR3Q8TD06 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGR3Q8TD06 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGR3Q8TD06 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGR3Q8TD06 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGR3Q8TD06 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGR3Q8TD06 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGR3Q8TD06 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGR3Q8TD06 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms