Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf43Q8TAL5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf43Q8TAL5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms