Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOXF1Q8NHV9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF1Q8NHV9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF1Q8NHV9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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