Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLHC1Q8NHS4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms