Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM58Q8NG06 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms