Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTSSBQ8NFR3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSBQ8NFR3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms