Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUP35Q8NFH5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP35Q8NFH5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms