Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHBP1Q8NDI1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
EHBP1Q8NDI1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHBP1Q8NDI1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHBP1Q8NDI1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms