Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RDH13Q8NBN7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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