Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM1BQ8NB78 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1BQ8NB78 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms