Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C9orf106Q8NAJ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf106Q8NAJ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C9orf106Q8NAJ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf106Q8NAJ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf106Q8NAJ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms