Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L2Q8NAA4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L2Q8NAA4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L2Q8NAA4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L2Q8NAA4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG16L2Q8NAA4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG16L2Q8NAA4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG16L2Q8NAA4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG16L2Q8NAA4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG16L2Q8NAA4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG16L2Q8NAA4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG16L2Q8NAA4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L2Q8NAA4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms