Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2AQ8NA29 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MFSD2AQ8NA29 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms