Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBR7Q8N806 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBR7Q8N806 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms