Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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RNF148Q8N7C7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF148Q8N7C7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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