Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC17Q8N6Y2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC17Q8N6Y2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms