Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf53Q8N6V4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf53Q8N6V4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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