Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM20Q8N5G0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMIM20Q8N5G0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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