Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C17orf53Q8N3J3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C17orf53Q8N3J3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C17orf53Q8N3J3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms