Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGI4Q8N135 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGI4Q8N135 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI4Q8N135 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms