Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZT9

FAM9C, Protein FAM9C, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM9CQ8IZT9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM9CQ8IZT9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM9CQ8IZT9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM9CQ8IZT9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms