Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYJ1

CPNE9, Copine-9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE9Q8IYJ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE9Q8IYJ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE9Q8IYJ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE9Q8IYJ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms