Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY84

NIM1K, Serine/threonine-protein kinase NIM1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIM1KQ8IY84 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NIM1KQ8IY84 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NIM1KQ8IY84 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NIM1KQ8IY84 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NIM1KQ8IY84 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NIM1KQ8IY84 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NIM1KQ8IY84 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NIM1KQ8IY84 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NIM1KQ8IY84 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NIM1KQ8IY84 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NIM1KQ8IY84 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms