Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIMKLAQ8IXN7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMKLAQ8IXN7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIMKLAQ8IXN7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIMKLAQ8IXN7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms