Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR0

TRAPPC5, Trafficking protein particle complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5Q8IUR0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC5Q8IUR0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC5Q8IUR0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC5Q8IUR0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC5Q8IUR0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC5Q8IUR0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC5Q8IUR0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC5Q8IUR0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC5Q8IUR0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms