Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPBP1Q86WP2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPBP1Q86WP2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPBP1Q86WP2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GPBP1Q86WP2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPBP1Q86WP2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPBP1Q86WP2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPBP1Q86WP2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPBP1Q86WP2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms