Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNEQ86WN2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNEQ86WN2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNEQ86WN2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms