Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCA5Q86VQ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCA5Q86VQ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCA5Q86VQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms