Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPM2Q86SE8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NPM2Q86SE8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NPM2Q86SE8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NPM2Q86SE8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms