Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC3Q7Z5M5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMC3Q7Z5M5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC3Q7Z5M5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms