Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC11Q7Z392 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms