Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP9Q7RTR0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NLRP9Q7RTR0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms