Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPUQ71F23 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPUQ71F23 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPUQ71F23 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms