Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM47EQ6ZV65 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms