Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD7Q6ZUT3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD7Q6ZUT3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD7Q6ZUT3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD7Q6ZUT3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD7Q6ZUT3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD7Q6ZUT3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms