Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LINC00299Q6ZSB3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LINC00299Q6ZSB3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00299Q6ZSB3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms