Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00114Q6XXX2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00114Q6XXX2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00114Q6XXX2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms