Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PACS1Q6VY07 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACS1Q6VY07 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACS1Q6VY07 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms