Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VITQ6UXI7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VITQ6UXI7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms