Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCBE1Q6UXH8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms