Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM198BQ6UWH4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM198BQ6UWH4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM198BQ6UWH4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144 ms