Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD3Q6STE5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMARCD3Q6STE5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD3Q6STE5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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