Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNCKQ6P2M8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNCKQ6P2M8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms