Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRGCQ6NXR0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRGCQ6NXR0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms