Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC70Q6NSX1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC70Q6NSX1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms