Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LCN12Q6JVE5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LCN12Q6JVE5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCN12Q6JVE5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms