Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG16L1Q676U5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 333.1 ms