Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LARP1BQ659C4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms