Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCNX4Q63HM2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCNX4Q63HM2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PCNX4Q63HM2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms