Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM236Q5W0B7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM236Q5W0B7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM236Q5W0B7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms